カカオのDNAバーコーディングDNA barcoding of cacao strains

目的/Aim: 生薬カカオ脂の基原植物でありチョコレートの原料でもあるカカオに知られる様々な品種を、DNA情報により識別する方法を開発する.
To develop DNA barcoding method that distinguishs strains of cacao trees.
方法/Method: DNAバーコーディング法.
DNA barcoding.
キキョウの遺伝的多様性解析Genetic diversity of an endangered plant, Platycodon grandiflorus

目的/Aim: 生薬キキョウコンの基原植物で、我が国では絶滅危惧II類に指定されているキキョウの遺伝的多様性解析を行い、全国の薬用植物園には遺伝的に多様な個体が保持されているのか否かを検証する.
To evaluate if/how a nationally endangered medicinal herb, Platycodon grandiflorus has enough genetic diversity in Japan.
方法/Method: ハプロタイプ解析及び集団遺伝学的解析.
Population genetics approach.
クサミズキの遺伝子発現解析Differential gene expression among regional individuals of Nothapodytes nimmoniana

目的/Aim: 抗がん剤原料であるカンプトテシンが抽出されるクサミズキに着目し、個体間での遺伝子発現の差異を明らかにする.
To evaluate if/how a medicinal tree, Nothapodytes nimmoniana shows variation of gene expression among regional individuals.
方法/Method: RNA-seqによる遺伝子発現解析.
Transcriptome analysis by RNA-seq.
写真撮影:インド・マハラシュトラ州/Photo taken at: Maharashtra, India
ミシマサイコの遺伝的多様性解析Genetic diversity of an endangered plant, Bupleurum falcatum

目的/Aim: 生薬サイコの基原植物で我が国では絶滅危惧種になっているミシマサイコの遺伝的多様性解析を行い、十分な遺伝的多様性を保持しているかどうかを検証する.
To evaluate if/how a nationally endangered medicinal herb, Bupleurum falcatum has enough genetic diversity in Japan.
方法/Method: ハプロタイプ解析及び集団遺伝学的解析.
Population genetics approach.
ムラサキの集団遺伝学Population genetics of Lithospermum erythrorhizon

目的/Aim: 東アジア原産の薬用植物ムラサキと、その近縁種で外来種のセイヨウムラサキが交雑しているかどうかを明らかにする.
To test if an indigenous Lithospermum erythrorhizon and an introduced Lithospermum officinale are hybridized.
方法/Method: 集団遺伝学的解析.
Population genetics approach.
左:セイヨウムラサキ;右:ムラサキ
L: Lithospermum officinale; L. erythrorhizon
テンダイウヤクの遺伝的構造解析Genetic structure of Lindera aggregata

目的/Aim: 日本で野生化している中国原産の薬用植物テンダイウヤクの遺伝的構造を解析し、同種の中で最も薬効が強いとされる浙江省天台産との近縁関係を明らかにする.
To evaluate if/how the naturalised Lindera aggregata in Japan is genetically close to those in Tiantai, Zhejiang, which is believed to be the most useful as medicine.
方法/Method: RAD-seqを用いた分子系統解析及び系統地理学的解析.
Molecular phylogenetic and biogeographic approaches using RAD-seq data.
協力研究者/Collaborator(s): 李捷 教授(中国・シーサンバンナ熱帯植物園)
Prof. Jie Li (Xishuangbanna Tropical Botanical Garden, China)